1、重点审核法

工程预算款有很多的分部工程预算款组成，每一个分部工程款又由人工，材料，施工机械施工费，规费，税金，利润等组成。由于组成要素较多，在进行工程预算款的审核时，如果对每一个分部分项工程预算款进行详细的审核，不仅浪费时间还会增加工程审核费，造成不必要的损失。因此，在进行工程预算款审核时，应该以施工重难点部位作为预算款审核的重点，对经济价值较大的部位进行全面细致的检查。同时，为了缩短预算款的审核时间，对其他经济价值相对较少的部位可以忽略不查，全面提高审核效率。

2、对比审核法

分析对比审核法就是通过对比具有可比性的项目，对其用途，功能，结构等进行全面细致的分析比较，确定其在建设过程中各种资源的需求量，明确竣工结算结果与工程预算款之间的差异，找出建设项目个分部分项工程的工程造价规律。建筑施工过程中常见的指标有：不同单位内的造价，建筑项目基础，电气照明，门窗及屋面的比例等。

3、综合审核法

所谓综合审核法就是将整个工程项目看作为审核对象，对项目建设过程中各阶段的经费进行全面细致的检查，使得个项目经费的计算方式和工程预算款的编制在一定程度上保持一致。同上面两种审核方法相比，综合审核法使用与工程量较小，工程建设规模适中的建设项目，且这种审核方法的精度较高，误差较小。